合肥工业大学生物医学工程专业创办于2001年，培养从事生物医学工程信息及医学电子仪器领域的高级工程技术人才。要求学生较系统地掌握电子技术、计算机技术、信息处理技术和智能控制等学科的基础理论与专业知识，并掌握一定的生物学与医学的基础知识，具有将生物医学与工程技术相结合的科学研究能力。
该专业的主干课程包括：电路理论、电子技术、生物化学、解剖学、生理学、电磁场理论、信号与系统、数字信号处理、图象处理、生物医学信号检测与传感器、生物医学信号处理、计算机原理及其应用、医学电子及智能仪器等。
学生毕业后，可在生物医学电子工程、医学电子仪器、医学信息处理以及其他电子技术、计算机技术、信息技术的应用领域从事科研、教学及管理等方面的工作。本专业的毕业生具有基础扎实、专业面宽和创新意识强的特点，深受用人单位的欢迎，近年来本专业毕业生一次就业率近95%。
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