安徽中医药大学医药信息工程学院成立于2002年4月。是在全国中医药院校中，较早开办中医药与现代信息技术相结合的、富有特色的本科专业。2012年安徽省中医药科学院成立，其中，安徽省计算机中医应用研究所下设我学院。

学院现有信息管理与信息系统、计算机科学与技术（医药软件开发方向）、计算机科学与技术（2+2中韩校际交流）、计算机科学与技术（信息系统工程监理方向）和生物医学工程5个全日制本科专业（方向），着重培养具备中医药背景知识的医药信息技术、医药信息管理和医药软件开发等能力，具有创新精神的跨学科高级复合型人才。我院“2+2”中韩合作办学模式，已成为我校开展国际交流合作办学的示范性窗口，极大地提升了我校的知名度和美誉度；“3+1”校企合作办学模式为学生提供了实习、实训平台，增强了学生实践动手能力，极大地提高了学生的就业质量。

学院现设计算机基础、信息资源管理、信息系统设计、中医药信息学、生物医学工程、数学与物理、软件工程、网络技术与应用等8个教研室和1个计算机与信息实验教学研究中心。现有教职工61人，其中教授1人，副教授11人，博士3人，博士在读3人，硕士学历人数达100%。

学院重视学科建设，中医药信息学2012年被遴选为国家中医药管理局重点学科，学院获中医药信息学硕士学位授权及免试推荐攻读硕士研究生单位。

学院一贯重视学生的能力培养，我院学生获2010年安徽省大学生“炜煌”杯单片机大赛一等奖1项、安徽省大学生“凌翔”杯机器人大赛二等奖2项；2011年安徽省大学生“炜煌”杯单片机大赛三等奖1项、全国大学生“飞思卡尔”杯智能车竞赛（安徽赛区）二等奖2项，三等奖1项；2012年全国大学生“飞思卡尔”杯智能车竞赛（安徽赛区）二等奖1项，三等奖1项、安徽省大学生信息技术大赛二等奖1项；2013年全国学生“飞思卡尔”杯智能车竞赛（安徽区）二等奖2项。

学院目前承担各类省级教学、科研课题近20项，校级教学、科研课题40余项。

目前，学院现有全日制在校生1000余人。建院十多年来，培养了一大批社会需求、用人单位所认可的，具有远大志向、有良好思想品德、社会公德和职业道德的优秀人才。毕业生就业率，连续多年都在98%以上。

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