信息工程学院成立于2013年6月，学院下设3个正科级机构：学院办公室、学生工作办公室、教学科研办公室；3个教研室：信息工程教研室、软件工程教研室、计算机基础教研室；1个研究所：中医药信息化研究所。
学院现有教职工23人，其中教师20人；副教授9人，高级工程师1人，讲师11人；博士1人，硕士18人，硕士以上学历教师达到90％。师资队伍整体结构比较合理，有丰富的教学经验。学院现设医学信息工程专业1个，承担医学信息工程c语言、计算机导论、面向对象程序设计、计算机组成原理等专业课程和全校计算机应用公共课及医学信息系统、VFP程序设计、flash制作、photoshop设计、多媒体课件设计等选修课程。
学院现有计算机教学机房5个，网络实验室1个，微机原理实验室1个，医学信息系统实验室1个，医学数据挖掘实验室1个，接口技术与嵌入式系统1个，电子学习室1个。具备较强的学科支撑和实验教学条件，实验教学的软硬件条件都能满足本专业开设的需要。到2015年建成软件开发与测试实训室1个、嵌入式系统实验室1个；到2016年建设虚拟社区医院实验室1个，网络工程综合实训室1个。到2017年与各教学医院实现网络互连，建设远程诊疗实训室1个。学院以数字化校园为基础，积极建设数字化附属医院，加快中医药信息化的建设进程，努力建成中医药信息化教学、科研、医疗的公共平台。
学院坚持科研工作同教学相结合的方针，近五年来承担省级科研项目20余项，教改课题8项，出版学术专著、合著近30部，发表学术论文80余篇，获得甘肃省教学成果一等奖1项，二等奖1项，厅级奖1项。
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