玉溪农业职业技术学院前身是始建于1956年的玉溪农业学校。1993年学校被省政府认定为“省部级重点中专学校”；2000年被教育部评定为首批“国家级重点中专学校”；2002年学校升格为高职院校，成为玉溪市唯一一所以举办职业技术教育为主的全日制普通高等学校。目前已形成以专科为主体，中专、本科多层次学历教育和服务类短期培训并存的办学格局, 先后开设了烟草栽培技术、园艺技术、畜牧兽医、财务会计、计算机应用技术、农畜特产品加工、农业经济管理、室内设计技术等27个专业，涵盖种植技术、养殖技术、电子信息技术、财经管理、农产品加工技术、公共事业管理与服务、设计技术七大职业门类，初步形成较为合理的专业结构体系。
学院坚持内涵式发展，以服务“三农”为宗旨，以就业为导向，以教学为中心，走产学结合的发展道路,在人才培养模式探索、教学管理、专业建设等方面取得一些成果。
◆ 2008年，学院被省教育厅评为“云南省高校教学管理先进单位”
◆ 2010年，学院被云南省高职高专学会评为“云南省职业教育先进集体”。
◆ 2008年，园艺艺被省教育厅评为“云南省高校教学管理先进集体”。
◆ 2007年，由中央财政支持投资300万元建设了园艺技术专业实训基地，2009年12月已建成。
◆ 2008年烟草栽培技术专业校外实训基地建设成为了省级示范性实训教学基地。
◆ 2009年畜牧兽医专业校外实训基地建设成为了省级示范性实训教学基地。
◆2012年烟草栽培技术专业获中央财政“支持高等职业学校提升专业服务产业发展能力”项目支持。
◆ 就业率持续稳定，近年来先后获得就业目标责任考核先进奖、优秀奖、二等奖等奖项。并组建宠物医院、裕生商行等实体，为学生就业、创业提供实践机会。
◆ “十一五”期间，为当地的烟草行业培养、培训种烟能手1万余名，烘烤能手3000余名，烤烟辅导员5000余名，烟叶收购人员1000余名，预检人员500余名。