| 学院代码 | 学院名称 | 联系部门 | 联系人 | 办公电话 | 办公地点 | 传真 |
| 001 | 基础医学院 | 教学科研办 | 王老师 | 0591-22862745 | 上街校区2号楼东区303室 | 0591-22862045 |
| 002 | 公共卫生学院 | 学院办公室 | 杨老师 | 0591-22862510 | 上街校区3号楼西区302室 | 0591-22862510 |
| 003 | 药学院 | 学院办公室 | 张老师 | 0591-22862016 | 上街校区药学院北楼5F学院办公室（一） | 0591-22862016 |
| 004 | 护理学院 | 学院办公室 | 王老师 | 0591-22862526 | 上街校区田家炳楼东区南楼204室 | 0591-22862526 |
| 005 | 口腔医学院 | 科教科 | 张老师 王老师 | 0591-83736426 | 福建医科大学附属口腔医院宿舍区204 | 0591-83720599 |
| 006 | 医学技术与工程学院 | 学院办公室 | 陈老师 | 0591-83569250 | 福建医科大学台江校区F楼南613 | 0591-83569250 |
| 007 | 人文学院 | 学院办公室 | 冯老师 | 0591-22862389 | 上街校区田家炳楼西幢405室 | 0591-22862716 |
| 008 | 第一临床医学院 | 医学教育科 | 翁老师 | 0591-87981093 | 交通路校区C教学楼二层医学教育科 | 0591-87981093 |
| 009 | 第二临床医学院 | 临床教学办 | 吴老师 | 0595-22793591 | 福建医科大学附属第二医院门诊楼九楼 | 0595-22770258 |
| 010 | 协和临床医学院 | 教务处 | 陈老师 | 0591-86218636 | 福建医科大学附属协和医院9号楼八楼 | 0591-83370393 |
| 011 | 省立临床医学院 | 科研处 | 陈老师 练老师 | 0591-88216023 | 福州市五四路口省立公寓二楼科研处 | 0591-87532356 |
| 012 | 福总临床医学院 | 科训科 | 吴老师 | 0591-22859650 | 福州市西二环北路156号办公楼二楼 | 0591-24937021 |