管理学院的使命是创造管理思想与工具，培养管理英才与领袖
管理学院遵循交流、开放和国际联合的原则办学，与北美、澳大利亚、日本、新加坡及香港、台湾地区的大学与研究机构建立了紧密的合作关系和培养计划。管理学院聘有数十名国内外知名专家和学者作为顾问和兼职教授，他们的参与使管理学院的教学和研究与社会需要密切结合。广泛的社会联系为高年级和研究生提供了大量的社会实践机会。
基础扎实、融会贯通、视野开阔、实际工作能力强是科大管理学院毕业生的特点。管理学院有一支实力雄厚的研究与教学队伍。十余年来，已培养了数百名中高级工商管理人才；毕业生在社会上做出了优秀的成绩，很多已成为企业、政府和金融部门的管理骨干。
管理学院本科生前两年的课程突出数理和基本技能训练，除统计专业由数学系招生并进行前期教学培养外，其他学生入学后前一年不分专业，后三年根据学生自己的兴趣在院内选择专业（不包括统计专业），并根据各专业的要求进行专业理论和专业技能培养。统计分析手段和计算机应用技术的训练将贯穿于整个培养过程之中。
管理学院下设工商管理系、管理科学系、统计与金融系，及MBA(工商管理硕士)、EMBA(高级工商管理硕士)、MPA(公共管理硕士)、MPM(项目管理工程硕士)四个专业学位教育中心和EDP高层管理者培训与发展项目中心，同时设有数字化管理研究所、信息与决策研究所、统计咨询中心、电子商务研究实验室等。管理学院设有工商管理、管理科学与工程、金融工程（管理科学与工程一级学科项下的专业）、概率论与数理统计四个学士、硕士、博士科学学位和工商管理(MBA)、高级工商管理（EMBA）、项目管理（MPM）、和物流工程（MLE）和金融专业硕士（MF）五个专业硕士。
近5年来，管理学院的科研能力呈现强劲的上升势头，已稳居全国管理科学与工程学科前十位。2007年大陆教育部学位与研究生教育发展中心公布的管理科学与工程一级学科排名中，管理学院位居全国第10位。管理学院的教师2008-2012年一共发表了669篇同行评审期刊论文（每年论文数都超过了120篇），人均7篇。其中国际刊物学术论文为426篇，SSCI、SCI和EI检索的文章299篇。这五年间还出版了研究专著4部、书籍10本、咨询和研究报告45份。取得了令人瞩目的成果。从系别上看，在发表的669篇同行评审期刊论文中管理科学与工程系、工商管理系分别为477篇和192篇。2008-2012年一共获得了57.689百万元人民币的研究经费（约合9.1721百万美元），人均62万元。其中国家基金42.907百万元，企业基金7.574百万元，国际合作研究基金7.208百万元。尤其是2012年，获得的经费大幅增长，全年经费总额为26.734百万元，占五年经费总额的46%；其中国家基金21.998百万元，占五年获得国家基金经费总额的51%。
管理学院当前正在推进AACSB（theAssociationtoAdvanceCollegiateSchoolsofBusiness，国际精英商学院协会）认证。AACSB是一个总部在美国的商学院教育认证的国际机构。自1916年成立以来，全球共有38个国家的620个商学院获得了AACSB认证，其中包括五家中国大陆商学院：上海交大安泰经管学院、上海交大中欧管理学院、复旦大学管理学院、清华大学经管学院、西安交大管理学院。
在今后的发展阶段，管理学院将继续以“顶天（理论水平高）立地（实践能力强）”的教研宗旨，围绕既定的战略目标和长期规划，健康有序、踏实稳健地开展各项教学、科研和管理工作，以“红专并进理实交融”的校训为指南，本着“创一流成果服务中国育一流人才建设中国”的愿景目标，努力创造体现国际水平、中国情景、国家需求的一流成果，致力培养具有创新思维、全球视野、社会责任的管理领袖和管理精英，为社会发展和经济建设作贡献。
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